一種檢測(cè)CRISPR-Cas9脫靶效應(yīng)的方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201910115862.1 申請(qǐng)日 -
公開(公告)號(hào) CN109971842A 公開(公告)日 2019-07-05
申請(qǐng)公布號(hào) CN109971842A 申請(qǐng)公布日 2019-07-05
分類號(hào) C12Q1/686(2018.01)I; C12Q1/6869(2018.01)I 分類 生物化學(xué);啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物學(xué);酶學(xué);突變或遺傳工程;
發(fā)明人 鄧濤; 李倩; 王越; 喻堃; 盧鈾 申請(qǐng)(專利權(quán))人 成都美杰賽爾生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 成都玖和知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 代理人 胡琳梅
地址 610041 四川省成都市高新區(qū)益州大段中段722號(hào)2棟1單元6層612號(hào)
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種檢測(cè)CRISPR?Cas9脫靶效應(yīng)的方法,屬于基因工程技術(shù)領(lǐng)域,其步驟包括:a.采用軟件預(yù)測(cè)sgRNA的脫靶位點(diǎn),并獲得PCR擴(kuò)增引物;b.選取基因樣本,所選基因樣本包括基因編輯樣本和未進(jìn)行基因編輯樣本;c.PCR擴(kuò)增預(yù)測(cè)出的脫靶位點(diǎn);d.對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行高通量測(cè)序;e.結(jié)果分析,序列比對(duì);本發(fā)明根據(jù)指定的比對(duì)規(guī)則,將所述基因編輯后的樣本與未進(jìn)行基因編輯的對(duì)照樣本進(jìn)行比對(duì),而不僅僅和數(shù)據(jù)庫(kù)中的信息進(jìn)行比對(duì),也不需要獲得子代或親本樣本基因信息,實(shí)現(xiàn)個(gè)性化的找尋細(xì)胞基因組上的可能脫靶位點(diǎn),提高脫靶檢測(cè)的準(zhǔn)確度和靈敏度,從而提高了基因編輯的安全性。