一種檢測CRISPR-Cas9脫靶效應(yīng)的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910115862.1 申請日 -
公開（公告）號 CN109971842A 公開（公告）日 2019-07-05
申請公布號 CN109971842A 申請公布日 2019-07-05
分類號 C12Q1/686（2018.01）I; C12Q1/6869（2018.01）I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 鄧濤; 李倩; 王越; 喻堃; 盧鈾 申請（專利權(quán)）人 成都美杰賽爾生物科技有限公司
代理機構(gòu) 成都玖和知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 胡琳梅
地址 610041 四川省成都市高新區(qū)益州大段中段722號2棟1單元6層612號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種檢測CRISPR?Cas9脫靶效應(yīng)的方法，屬于基因工程技術(shù)領(lǐng)域，其步驟包括：a.采用軟件預(yù)測sgRNA的脫靶位點，并獲得PCR擴增引物；b.選取基因樣本，所選基因樣本包括基因編輯樣本和未進行基因編輯樣本；c.PCR擴增預(yù)測出的脫靶位點；d.對PCR產(chǎn)物進行高通量測序；e.結(jié)果分析，序列比對；本發(fā)明根據(jù)指定的比對規(guī)則，將所述基因編輯后的樣本與未進行基因編輯的對照樣本進行比對，而不僅僅和數(shù)據(jù)庫中的信息進行比對，也不需要獲得子代或親本樣本基因信息，實現(xiàn)個性化的找尋細胞基因組上的可能脫靶位點，提高脫靶檢測的準(zhǔn)確度和靈敏度，從而提高了基因編輯的安全性。