用于疾病亞型問題的基于網(wǎng)絡(luò)的聚類方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201510532877.X 申請日 -
公開（公告）號 CN105160208A 公開（公告）日 2015-12-16
申請公布號 CN105160208A 申請公布日 2015-12-16
分類號 G06F19/24(2011.01)I 分類 計(jì)算；推算；計(jì)數(shù);
發(fā)明人 孔德興;方紅晟 申請（專利權(quán)）人 杭州奧視圖像技術(shù)有限公司
代理機(jī)構(gòu) 杭州中成專利事務(wù)所有限公司 代理人 周世駿
地址 310023 浙江省杭州市西湖區(qū)留和路129號315室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及逆向研究疾病亞型領(lǐng)域，旨在提供用于疾病亞型問題的基于網(wǎng)絡(luò)的聚類方法。該用于疾病亞型問題的基于網(wǎng)絡(luò)的聚類方法包括過程：獲得O-G矩陣以及基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)；選取適用于具體問題的基于網(wǎng)絡(luò)的距離定義，構(gòu)建距離矩陣；運(yùn)用k-medoids算法對O-G矩陣進(jìn)行聚類分析，聚類時(shí)距離的選擇用基于網(wǎng)絡(luò)的距離。本發(fā)明對于特定的基因網(wǎng)絡(luò)，將有更好的組間相似性，能更有效地還原三種亞型；當(dāng)有大量的基因需要測定其表達(dá)數(shù)據(jù)時(shí)，本發(fā)明通過優(yōu)先精確測量信息基因的表達(dá)數(shù)據(jù)，不會(huì)大大地削弱對于疾病亞型的鑒定效果。