基于高通量測序用于地中海貧血大樣本篩查的建庫方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201710267517.0 申請日 -
公開(公告)號 CN108728903A 公開(公告)日 2018-11-02
申請公布號 CN108728903A 申請公布日 2018-11-02
分類號 C40B50/06 分類 組合技術(shù)〔8〕;
發(fā)明人 陳川;陳建國;張靜;王瑢;楊傳春;張文勇 申請(專利權(quán))人 深圳市樂土精準(zhǔn)醫(yī)療科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 深圳鼎合誠知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 孫銀行;彭家恩
地址 518000 廣東省深圳市南山區(qū)沙河西路深圳灣科技生態(tài)園一區(qū)2棟C座9層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 一種基于高通量測序用于地中海貧血大樣本篩查的建庫方法,包括:使用帶有標(biāo)簽序列的特異性引物分別擴(kuò)增HBA1、HBA2和HBB基因,其中標(biāo)簽序列用于區(qū)分不同樣本;將不同樣本的相同基因的擴(kuò)增產(chǎn)物混合,然后將混合后的不同基因的擴(kuò)增產(chǎn)物混合;對混合產(chǎn)物進(jìn)行純化;對純化產(chǎn)物進(jìn)行不完全打斷;進(jìn)行5’磷酸化平末端修復(fù)和3’末端加A,獲得具有5’磷酸化和3’粘性末端A的DNA片段;將DNA片段與含有區(qū)分文庫的唯一條形碼序列的接頭相連;對連接產(chǎn)物進(jìn)行純化,獲得適用于高通量測序的上機(jī)文庫。本發(fā)明的方法能夠覆蓋目前已知的與地中海貧血相關(guān)的245種HBB基因突變類型和93種HBA基因突變類型,同時也能檢測出目標(biāo)區(qū)域范圍內(nèi)的新發(fā)型別。