一種確定核酸序列的方法及系統(tǒng)

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201610193209.3 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN105925664A 公開(kāi)（公告）日 2016-09-07
申請(qǐng)公布號(hào) CN105925664A 申請(qǐng)公布日 2016-09-07
分類(lèi)號(hào) C12Q1/68(2006.01)I;G06F19/22(2011.01)I 分類(lèi) 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 張印新;韓穎鑫;王佳偉;高曉峘;張春生;李勝 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 廣州精科生物技術(shù)有限公司
代理機(jī)構(gòu) 深圳市賽恩倍吉知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 廣州精科生物技術(shù)有限公司;廣州精科醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司
地址 510663 廣東省廣州市國(guó)際生物島螺旋四路7號(hào)第6層602單元
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種確定核酸序列的方法，包括，獲取待測(cè)樣本中的核酸，對(duì)所述核酸進(jìn)行測(cè)序，獲得由多個(gè)測(cè)序序列構(gòu)成的測(cè)序結(jié)果；將所述測(cè)序結(jié)果進(jìn)行過(guò)濾，所述過(guò)濾包括去除不確定堿基比例大于1%的讀段和/或堿基質(zhì)量值不大于5的堿基數(shù)的比例不小于50%的讀段，獲得過(guò)濾后的測(cè)序結(jié)果；將所述過(guò)濾后的測(cè)序結(jié)果與第一數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行第一比對(duì)，獲得第一比對(duì)結(jié)果；以及將所述第一比對(duì)結(jié)果與第二數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行第二比對(duì)，獲得第二比對(duì)結(jié)果；分析所述第二比對(duì)結(jié)果，確定待測(cè)樣本的核酸序列。本發(fā)明還提供一種確定核酸序列的系統(tǒng)。本發(fā)明基于生物信息學(xué)分析手段與強(qiáng)大的數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)來(lái)對(duì)樣本中的微生物種類(lèi)進(jìn)行鑒定，具有結(jié)果靈敏、特異性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn)。