一種基于PGM高通量測序技術指導幽門螺桿菌根除用藥的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201610194552.X 申請日 -
公開（公告）號 CN107236787A 公開（公告）日 2017-10-10
申請公布號 CN107236787A 申請公布日 2017-10-10
分類號 C12Q1/68(2006.01)I;C12R1/01(2006.01)N 分類 生物化學；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學；酶學；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 楊比特;許佩松;楊寧敏 申請（專利權）人 杭州致遠醫(yī)學檢驗所有限公司
代理機構 - 代理人 -
地址 310030 浙江省杭州市西湖區(qū)西園二路1號2幢6層-1
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種基于PGM高通量測序技術指導幽門螺桿菌根除用藥的方法，其主要是針對于幽門螺桿菌對抗生素的耐藥性以及宿主藥物代謝酶類型的檢測。本方法主要包括：設計覆蓋VacA、23SrRNA、gyrA、CYP2C19*2、CYP2C19*3基因待測區(qū)域的特異性引物，形成Primer?Pool；提取宿主和幽門螺桿菌基因組進行擴增；進行PGM文庫制備、純化、定量、測序；計算出耐藥比例和藥物代謝酶類型。本發(fā)明利用多重PCR技術實現(xiàn)多位點的同時擴增，結合PGM測序，有利于指導臨床關于幽門螺桿菌的檢測和根除。