一種非診斷目的的檢測幽門螺桿菌基因及藥物代謝型的Miseq測序方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201610194555.3 申請日 -
公開（公告）號 CN107236788B 公開（公告）日 2021-07-02
申請公布號 CN107236788B 申請公布日 2021-07-02
分類號 C12Q1/6869;C12Q1/689;C12Q1/04 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 楊比特;許佩松;楊寧敏 申請（專利權(quán)）人 杭州致遠(yuǎn)醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司
代理機(jī)構(gòu) - 代理人 -
地址 310030 浙江省杭州市西湖區(qū)西園二路1號2幢6層-1
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種同時(shí)檢測幽門螺桿菌基因及藥物代謝型的Miseq測序方法，其包括以下幾步：設(shè)計(jì)覆蓋UreB、23SrRNA、gyrA、CYP2C19*2、CYP2C19*3基因待測區(qū)域的特異性引物，形成Primer Pool；提取宿主和幽門螺桿菌基因組進(jìn)行擴(kuò)增：二次擴(kuò)增進(jìn)行文庫制備、純化、定量；Miseq高通量測序和分析；計(jì)算出耐藥比例和藥物代謝酶類型。本發(fā)明利用多重PCR技術(shù)將待測片段在一個(gè)反應(yīng)中實(shí)現(xiàn)擴(kuò)增，結(jié)合Miseq測序和分析，即可獲得幽門螺桿菌感染情況、耐藥情況及宿主藥物代謝酶CYP2C19基因多態(tài)性類型，有利于指導(dǎo)臨床關(guān)于幽門螺桿菌的檢測和根除。