一種檢測(cè)幽門螺桿菌基因及藥物代謝型的Miseq測(cè)序方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201610194555.3 申請(qǐng)日 -
公開(公告)號(hào) CN107236788A 公開(公告)日 2021-07-02
申請(qǐng)公布號(hào) CN107236788A 申請(qǐng)公布日 2021-07-02
分類號(hào) C12Q1/68;C12Q1/04 分類 生物化學(xué);啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物學(xué);酶學(xué);突變或遺傳工程;
發(fā)明人 楊比特;許佩松;楊寧敏 申請(qǐng)(專利權(quán))人 杭州致遠(yuǎn)醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司
代理機(jī)構(gòu) - 代理人 -
地址 310030 浙江省杭州市西湖區(qū)西園二路1號(hào)2幢6層-1
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種同時(shí)檢測(cè)幽門螺桿菌基因及藥物代謝型的Miseq測(cè)序方法,其包括以下幾步:設(shè)計(jì)覆蓋UreB、23SrRNA、gyrA、CYP2C19*2、CYP2C19*3基因待測(cè)區(qū)域的特異性引物,形成Primer?Pool;提取宿主和幽門螺桿菌基因組進(jìn)行擴(kuò)增:二次擴(kuò)增進(jìn)行文庫制備、純化、定量;Miseq高通量測(cè)序和分析;計(jì)算出耐藥比例和藥物代謝酶類型。本發(fā)明利用多重PCR技術(shù)將待測(cè)片段在一個(gè)反應(yīng)中實(shí)現(xiàn)擴(kuò)增,結(jié)合Miseq測(cè)序和分析,即可獲得幽門螺桿菌感染情況、耐藥情況及宿主藥物代謝酶CYP2C19基因多態(tài)性類型,有利于指導(dǎo)臨床關(guān)于幽門螺桿菌的檢測(cè)和根除。