一種肺癌圍手術(shù)期分子殘留病灶基因檢測panel及檢測模型的構(gòu)建方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202111519375.5 申請日 -
公開（公告）號(hào) CN114187964A 公開（公告）日 2022-03-15
申請公布號(hào) CN114187964A 申請公布日 2022-03-15
分類號(hào) G16B20/50（2019.01）I;G16B20/30（2019.01）I;G16B20/20（2019.01）I;C40B50/06（2006.01）I;C12Q1/6886（2018.01）I;C12Q1/6806（2018.01）I 分類 物理
發(fā)明人 許明炎;何長壽;周衍慶;陳亞如;陳實(shí)富;楊慶;劉園園;張曉妮 申請（專利權(quán)）人 深圳市海普洛斯生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京方圓嘉禾知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 戴嵩瑋
地址 518000廣東省深圳市前海深港合作區(qū)前灣一路1號(hào)A棟201室（入駐深圳市前海商務(wù)秘書有限公司）
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種肺癌圍手術(shù)期分子殘留病灶基因檢測panel及檢測模型的構(gòu)建方法，涉及生物信息學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明通過整合腫瘤數(shù)據(jù)庫和TCGA、COSMIC等著名腫瘤公共數(shù)據(jù)庫，設(shè)計(jì)了一款覆蓋肺癌驅(qū)動(dòng)基因、靶向用藥基因及熱點(diǎn)突變的肺癌MRD基因檢測panel，并開發(fā)了一套檢測超低頻基因突變預(yù)測模型。本發(fā)明以大樣本量數(shù)據(jù)作為基礎(chǔ)，聚焦肺癌驅(qū)動(dòng)基因和熱點(diǎn)突變，保證檢測結(jié)果準(zhǔn)確性；超高測序深度，保證了超低頻檢測限，超低頻基因突變算法，提高突變檢測精準(zhǔn)度。本發(fā)明實(shí)施例證實(shí)，所述預(yù)測模型可以穩(wěn)定檢測0.02％的超低頻突變。