基于一代測序技術(shù)的自動化菌種鑒定方法、系統(tǒng)、終端及介質(zhì)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110645390.8 申請日 -
公開(公告)號 CN113345522A 公開(公告)日 2021-09-03
申請公布號 CN113345522A 申請公布日 2021-09-03
分類號 G16B30/10(2019.01)I;G16B30/20(2019.01)I;G16B40/10(2019.01)I;G16B50/30(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 胡萬金;黃龍;馬貝貝 申請(專利權(quán))人 上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司
代理機構(gòu) 上海光華專利事務(wù)所(普通合伙) 代理人 倪靜
地址 201321上海市浦東新區(qū)中國(上海)自由貿(mào)易試驗區(qū)高科中路2810弄8號1204室單元D
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明的基于一代測序技術(shù)的自動化菌種鑒定方法、系統(tǒng)、終端及介質(zhì),通過依次搭建的文件格式檢查、序列長度質(zhì)控、峰圖文件的雜峰判定、序列拼接和數(shù)據(jù)庫比對流程進行自動化菌種鑒定,本方案提供了完整的過濾質(zhì)控方法來判定一代測序數(shù)據(jù)的質(zhì)量,減少了工作運行的時間,提高了處理項目的效率,并且提高了鑒定的準(zhǔn)確性;并整合了對一代測序各數(shù)據(jù)處理方式的優(yōu)勢,做到了批量化處理一代測序數(shù)據(jù),并提供了后續(xù)更為重要的菌種鑒定功能,使得一代測序菌種鑒定的功能更加完善;更首次做到一代測序菌種鑒定流程自動化,極大的提高了工作效率。