基于甲基化數(shù)據(jù)的癌癥類型的預(yù)測方法及裝置

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201710785909.6 申請日 -
公開（公告）號 CN107506600B 公開（公告）日 2021-05-14
申請公布號 CN107506600B 申請公布日 2021-05-14
分類號 G16H50/20;G16B20/30;G16B40/00;G16B30/00 分類 物理
發(fā)明人 楊飛;任一;陳昌岳;鄭冠濤;王芳;李靜;路遠(yuǎn) 申請（專利權(quán)）人 上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 上海光華專利事務(wù)所（普通合伙） 代理人 徐秋平
地址 201321 上海市浦東新區(qū)中國(上海)自由貿(mào)易試驗區(qū)高科中路2810弄8號1204室單元D
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供基于甲基化數(shù)據(jù)的癌癥類型的預(yù)測方法及裝置，包括：從DNA甲基化芯片檢測到的DNA序列的甲基化數(shù)據(jù)中隨機(jī)選取某些位點(diǎn)的數(shù)據(jù)作為訓(xùn)練數(shù)據(jù)來訓(xùn)練分類器模型；其中，作為訓(xùn)練數(shù)據(jù)的甲基化數(shù)據(jù)所代表的癌癥種類為已知；通過訓(xùn)練好的分類器模型預(yù)測未知癌癥種類的DNA甲基化芯片數(shù)據(jù)可能代表的癌癥種類，或預(yù)測單細(xì)胞或多細(xì)胞的甲基化測序數(shù)據(jù)可能代表的癌癥種類。本發(fā)明從測得的甲基化數(shù)據(jù)中隨機(jī)選取某些位點(diǎn)的數(shù)據(jù)來訓(xùn)練分類器，可以在待測癌種類型的樣本的某些位點(diǎn)的甲基化數(shù)據(jù)沒有獲知時，令分類器根據(jù)和待測樣本已獲知的甲基化位點(diǎn)相同的位點(diǎn)的數(shù)據(jù)作訓(xùn)練，極大程度上提高了基于甲基化的癌種類型的預(yù)測的便利性。