基于DNA標記的犬類品系鑒定方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201711109335.7 申請日 -
公開（公告）號 CN107871060A 公開（公告）日 2018-04-03
申請公布號 CN107871060A 申請公布日 2018-04-03
分類號 G06F19/22;G06F19/24;G06F19/28;G06K9/62 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 劉毓文;楊承;耿燦 申請（專利權(quán)）人 深圳深知生物科技有限公司
代理機構(gòu) 深圳卓正專利代理事務所（普通合伙） 代理人 深圳深知生物科技有限公司
地址 518100 廣東省深圳市龍崗區(qū)龍崗街道清風大道39號C棟5樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種通過寵物犬DNA SNP標記準確進行品系鑒定的方法，所述方法包括步驟：1)獲得寵物犬DNA SNP標記數(shù)據(jù)；2)對步驟1)中所述的SNP標記數(shù)據(jù)進行層次聚類，所述層次聚類中加入了遷徙的參數(shù)；3)對步驟1)中所述的SNP標記數(shù)據(jù)進行種群混合物分析，所述種群混合物分析中，對混合品系的數(shù)量加以限制；4)將基因組分成小塊區(qū)域，并對每一個區(qū)域用隨機森林算法進行犬種歸類，用隱馬爾可夫鏈對小塊基因區(qū)域的品系歸類進行平滑處理，用最大釋然估計對家族譜系進行估計，獲得犬只父母的品系混合成分，完成譜系推斷。