判斷背景引入微生物序列的方法及其應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110466665.1 申請日 -
公開（公告）號 CN113270145A 公開（公告）日 2021-08-17
申請公布號 CN113270145A 申請公布日 2021-08-17
分類號 G16B30/10（2019.01）I;G16B40/20（2019.01）I;G16B40/30（2019.01）I;G16B50/00（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 許騰;何福生;李曉蕾;謝淑媚;王小銳;李永軍;蘇杭 申請（專利權(quán)）人 微遠(yuǎn)（深圳）醫(yī)學(xué)研究中心有限公司
代理機(jī)構(gòu) 廣州新諾專利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 代理人 李海恬
地址 510130廣東省廣州市高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開發(fā)區(qū)科豐路31號自編三棟華南新材料創(chuàng)新園G10棟303號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及一種判斷背景引入微生物序列的方法及其應(yīng)用，屬于生物信息分析技術(shù)領(lǐng)域。該方法包括以下步驟：確定背景微生物列表：取若干病原微生物陰性樣本，將各微生物豐度的定量值A(chǔ)與核酸總量D進(jìn)行相關(guān)性檢驗(yàn)，呈負(fù)相關(guān)則判定為背景病原微生物；判斷模型建立：分別取背景病原微生物的陰性對照樣本集和陽性樣本集，將背景病原微生物基因序列數(shù)據(jù)比對至該微生物的特征序列區(qū)域，計(jì)算豐度，建立判斷模型；微生物特異性區(qū)域定量分析：獲取待測樣本中背景病原微生物基因序列數(shù)據(jù)，采用上述判斷模型進(jìn)行判斷。該方法能夠準(zhǔn)確判斷測序所得微生物序列是否為背景引入，且可降低批次假陽或者假陰問題，可廣泛應(yīng)用于病原微生物檢測的數(shù)據(jù)分析中。