一種基于大數(shù)據(jù)的染色體異常位點的篩選方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201710492071.1 申請日 -
公開（公告）號 CN107194206A 公開（公告）日 2017-09-22
申請公布號 CN107194206A 申請公布日 2017-09-22
分類號 G06F19/22(2011.01)I;G06F19/28(2011.01)I 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 沈雨后 申請（專利權(quán)）人 精醫(yī)光瀚科技（上海）有限公司
代理機構(gòu) - 代理人 -
地址 201800上海市崇明縣長興鎮(zhèn)潘園公路1800號3號樓8376室（上海泰和經(jīng)濟發(fā)展區(qū)）
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本案為一種基于大數(shù)據(jù)的染色體異常位點的篩選方法，包括：建立數(shù)據(jù)庫：在PubMed數(shù)據(jù)庫中檢索文獻，根據(jù)所檢索文獻的摘要篩選出符合預(yù)設(shè)條件的相關(guān)聯(lián)文獻，將相關(guān)聯(lián)文獻下載到計算機的存儲器，建立一個數(shù)據(jù)庫；確定位點的比值比；核查位點的頻率：在HapMap數(shù)據(jù)庫中輸入所述位點，確定出在預(yù)設(shè)人群范圍內(nèi)所述HapMap數(shù)據(jù)庫中所述位點對應(yīng)基因型的研究頻率，剔除沒有頻率以及最小等位基因頻率小于3%的位點；預(yù)實驗驗證：選取細(xì)胞樣本并進行DNA抽提，采用RT?PCR技術(shù)進行DNA分型并進行數(shù)據(jù)分析，若數(shù)據(jù)分析顯示出預(yù)設(shè)分型結(jié)果，則將預(yù)設(shè)異常位點確定為異常位點。本案利用大數(shù)據(jù)能夠快速、精準(zhǔn)地篩選出染色體異常位點。