基于系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的泛基因組構(gòu)建方法和構(gòu)建裝置

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202010260748.0 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)(公告)號(hào) CN111477281A 公開(kāi)(公告)日 2020-07-31
申請(qǐng)公布號(hào) CN111477281A 申請(qǐng)公布日 2020-07-31
分類(lèi)號(hào) G16B40/30(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I 分類(lèi) -
發(fā)明人 張錦波;鮑冠輝;李季 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人 天津諾禾醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京康信知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 代理人 北京諾禾致源科技股份有限公司;北京諾禾致源生物科技有限公司;天津諾禾致源生物信息科技有限公司;天津諾禾醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司;南京諾禾致源生物科技有限公司
地址 102200北京市昌平區(qū)回龍觀鎮(zhèn)生命園路29號(hào)創(chuàng)新大廈B258室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種基于系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的泛基因組構(gòu)建方法和構(gòu)建裝置。該構(gòu)建方法包括:對(duì)不同株系的菌株進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建,得到系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù);根據(jù)不同株系的菌株在系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)上的不同位置,按照從底層到頂層的方向兩兩聚類(lèi),逐層進(jìn)行泛基因組構(gòu)建,得到不同株系總的泛基因組。該方法從底層到頂層的泛基因組構(gòu)建,不僅解決了現(xiàn)有方法中比對(duì)結(jié)果不準(zhǔn)確的問(wèn)題,而且使得每一個(gè)進(jìn)化節(jié)點(diǎn)的泛基因組都可以得到,從而可以從更加細(xì)致的進(jìn)化角度來(lái)分析存在/缺失變異結(jié)果。??