基于系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的泛基因組構(gòu)建方法和構(gòu)建裝置
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202010260748.0 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN111477281A | 公開(kāi)（公告）日 | 2020-07-31 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN111477281A | 申請(qǐng)公布日 | 2020-07-31 |
| 分類(lèi)號(hào) | G16B40/30(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I | 分類(lèi) | - |
| 發(fā)明人 | 張錦波;鮑冠輝;李季 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 天津諾禾醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京康信知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 | 代理人 | 北京諾禾致源科技股份有限公司;北京諾禾致源生物科技有限公司;天津諾禾致源生物信息科技有限公司;天津諾禾醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司;南京諾禾致源生物科技有限公司 |
| 地址 | 102200北京市昌平區(qū)回龍觀鎮(zhèn)生命園路29號(hào)創(chuàng)新大廈B258室 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供了一種基于系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的泛基因組構(gòu)建方法和構(gòu)建裝置。該構(gòu)建方法包括：對(duì)不同株系的菌株進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建，得到系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)；根據(jù)不同株系的菌株在系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)上的不同位置，按照從底層到頂層的方向兩兩聚類(lèi)，逐層進(jìn)行泛基因組構(gòu)建，得到不同株系總的泛基因組。該方法從底層到頂層的泛基因組構(gòu)建，不僅解決了現(xiàn)有方法中比對(duì)結(jié)果不準(zhǔn)確的問(wèn)題，而且使得每一個(gè)進(jìn)化節(jié)點(diǎn)的泛基因組都可以得到，從而可以從更加細(xì)致的進(jìn)化角度來(lái)分析存在/缺失變異結(jié)果。?? |
