基于微生物豐度的MIBC分型及預(yù)后預(yù)測模型構(gòu)建方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202210148697.1 申請日 -
公開（公告）號 CN114203256A 公開（公告）日 2022-06-21
申請公布號 CN114203256A 申請公布日 2022-06-21
分類號 G16B15/30;G16B20/00;G16B30/00;G16B40/00 分類 物理
發(fā)明人 金鴿;薛銀鴿;林為麗;徐小紅;趙婷婷 申請（專利權(quán)）人 上海仁東醫(yī)學(xué)檢驗所有限公司
代理機(jī)構(gòu) 上海市匯業(yè)律師事務(wù)所 代理人 陸紅杰
地址 201318 上海市浦東新區(qū)半夏路100弄11號1-3層、地下1層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種肌層浸潤性膀胱癌（MIBC）分型方法，該方法依據(jù)MIBC患者的組織微生物豐度譜特征對MIBC進(jìn)行分子分型。本發(fā)明還公開了基于上述分型方法的MIBC預(yù)后預(yù)測模型及其構(gòu)建方法。本發(fā)明利用TCGA數(shù)據(jù)庫中的肌層浸潤性膀胱癌轉(zhuǎn)錄組RNA?seq數(shù)據(jù)，分析得到MIBC患者的微生物數(shù)據(jù)，然后以微生物豐度譜為特征進(jìn)行NMF聚類，建立MIBC微生物層面的分子分型，從而從腫瘤組織微生物層面深度解析了微生物與MIBC的相關(guān)性，建立了MIBC預(yù)后預(yù)測模型，該模型有助于精準(zhǔn)預(yù)測MIBC患者的1?5年生存率。