微衛(wèi)星不穩(wěn)定的預(yù)測方法及其應(yīng)用

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202010098341.2 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN111304303A 公開（公告）日 2020-06-19
申請(qǐng)公布號(hào) CN111304303A 申請(qǐng)公布日 2020-06-19
分類號(hào) C12Q1/6858;G16B20/20;G16B20/30;G16B40/00 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 吳書昌;白健;王寅 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 福建和瑞精創(chuàng)基因技術(shù)有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京超凡宏宇專利代理事務(wù)所（特殊普通合伙） 代理人 潘浩
地址 350000 福建省福州市長樂市數(shù)字福建產(chǎn)業(yè)園東湖路33號(hào)7號(hào)研發(fā)樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種微衛(wèi)星不穩(wěn)定的檢測預(yù)測方法，以及相關(guān)的位點(diǎn)篩選方法、模型構(gòu)建方法及應(yīng)用。所述位點(diǎn)篩選方法：i）包含測定樣本中候選微衛(wèi)星位點(diǎn)的微衛(wèi)星不穩(wěn)定預(yù)測值的步驟；和/或ii）使用包括候選微衛(wèi)星位點(diǎn)的微衛(wèi)星不穩(wěn)定預(yù)測值在內(nèi)的一種或多種指標(biāo)篩選用于微衛(wèi)星不穩(wěn)定檢測的位點(diǎn)或位點(diǎn)組合；所述微衛(wèi)星不穩(wěn)定預(yù)測值是候選微衛(wèi)星位點(diǎn)中主等位基因（allele）型與次等位基因型之間豐度差異的量化值。本發(fā)明的方法準(zhǔn)確性高，僅基于單腫瘤樣本就可以精準(zhǔn)穩(wěn)定地檢測MSI狀態(tài)。