檢測HLA雜合性缺失的方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010302140.X 申請日 -
公開（公告）號 CN112885406A 公開（公告）日 2021-06-01
申請公布號 CN112885406A 申請公布日 2021-06-01
分類號 G16B20/20;G16B20/30;G16B30/10 分類 物理
發(fā)明人 朱嘉麒;聶新華;李艷 申請（專利權(quán)）人 深圳裕策生物科技有限公司
代理機構(gòu) 深圳鼎合誠知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 周建軍;郭燕
地址 518081 廣東省深圳市鹽田區(qū)海山街道深鹽路2002號大百匯高新技術(shù)工業(yè)園A棟913
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種檢測HLA雜合性缺失的方法及系統(tǒng)，該方法包括：數(shù)據(jù)獲?。韩@取腫瘤樣本和對照樣本的測序數(shù)據(jù)；HLA分型檢測：檢測腫瘤樣本、對照樣本的HLA分子類型；HLA等位基因不平衡檢測：將測序數(shù)據(jù)與HLA分型結(jié)果比對，獲得HLA等位基因不平衡檢測結(jié)果；拷貝數(shù)變異檢測：對所有目標(biāo)區(qū)域進行拷貝數(shù)變異檢測，獲得HLA基因座的拷貝數(shù)變異檢測結(jié)果；HLA雜合性缺失判斷：根據(jù)HLA等位基因不平衡檢測結(jié)果、拷貝數(shù)變異檢測結(jié)果，判斷是否為HLA雜合性缺失。本發(fā)明不只單獨使用HLA基因上的序列信息，還結(jié)合HLA基因附近的序列信息，得到準(zhǔn)確的HLA LOH結(jié)果。