一種檢測腫瘤異質(zhì)性程度的方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010231560.3 申請日 -
公開(公告)號 CN111402952A 公開(公告)日 2020-07-10
申請公布號 CN111402952A 申請公布日 2020-07-10
分類號 G16B20/30(2019.01)I 分類 -
發(fā)明人 金皓玄;方文峰;陳龍昀;蘇小凡;廖裕威 申請(專利權(quán))人 深圳裕策生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 深圳鼎合誠知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 深圳裕策生物科技有限公司
地址 518081廣東省深圳市鹽田區(qū)海山街道深鹽路2002號大百匯高新技術(shù)工業(yè)園A棟913
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種檢測腫瘤異質(zhì)性程度的方法及系統(tǒng),該方法包括:獲取腫瘤組織樣本和對照樣本的測序數(shù)據(jù),進(jìn)行體細(xì)胞變異檢測,獲得體細(xì)胞變異位點;將體細(xì)胞變異位點按簇進(jìn)行聚類;根據(jù)聚類結(jié)果,判斷主克隆突變簇和亞克隆突變簇;計算腫瘤組織樣本中亞克隆突變簇中的體細(xì)胞變異數(shù)量占所有體細(xì)胞變異數(shù)量的比值,該比值即為腫瘤異質(zhì)性數(shù)值。本發(fā)明充分利用樣本各突變位點檢測的突變頻率,估算出對應(yīng)腫瘤克隆的細(xì)胞占比,從而推算出腫瘤異質(zhì)性程度的具體數(shù)值,為后續(xù)預(yù)測免疫治療療效提供了一個數(shù)值上可以參考的依據(jù)。??