一種用于對(duì)病原體類型進(jìn)行自動(dòng)分析的方法及系統(tǒng)

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110331835.5 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN113096737A 公開（公告）日 2021-07-09
申請(qǐng)公布號(hào) CN113096737A 申請(qǐng)公布日 2021-07-09
分類號(hào) G16B30/10（2019.01）I;G16B20/30（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 杜鵬程;余樂;劉樹青 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 北京源生康泰基因科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京工信聯(lián)合知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 白曉晰
地址 100084北京市海淀區(qū)上地信息路26號(hào)1層0106-51室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種用于對(duì)病原體類型進(jìn)行自動(dòng)分析的方法及系統(tǒng)，首先通過兩種不同的算法對(duì)待測(cè)樣本的不同數(shù)據(jù)類型的第一測(cè)序讀段數(shù)據(jù)的病原體類型進(jìn)行初步判斷，然后進(jìn)行第二測(cè)序讀段數(shù)據(jù)的選取，然后將識(shí)別出的不同的病原體類型的第二測(cè)序讀段數(shù)據(jù)與對(duì)應(yīng)的病原體參考序列進(jìn)行比對(duì)驗(yàn)證和篩選，從而確定待測(cè)樣本中存在的病原體類型；本發(fā)明的方法能夠有效處理基于第三代測(cè)序技術(shù)產(chǎn)生的長(zhǎng)讀長(zhǎng)數(shù)據(jù)，減小了精確比對(duì)的計(jì)算量，能夠?qū)崿F(xiàn)典型三代宏基因組或宏轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)在30分鐘內(nèi)的準(zhǔn)確分析和報(bào)告生成，滿足了進(jìn)行快速病原檢測(cè)分析的需求；同時(shí)，該方法也能夠針對(duì)二代測(cè)序獲得的短讀長(zhǎng)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，具有較好的數(shù)據(jù)兼容性。