通過測序獲取微生物物種及相關(guān)信息的方法、裝置、計(jì)算機(jī)可讀存儲介質(zhì)和電子設(shè)備

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010790095.7 申請日 -
公開（公告）號 CN114067911A 公開（公告）日 2022-02-18
申請公布號 CN114067911A 申請公布日 2022-02-18
分類號 G16B30/10（2019.01）I;C12Q1/6869（2018.01）I 分類 物理
發(fā)明人 江山;楊玉梅;龐白冰;克里斯托弗·雷·約翰遜 申請（專利權(quán)）人 西安中科茵康萊醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)有限公司
代理機(jī)構(gòu) 廣州華進(jìn)聯(lián)合專利商標(biāo)代理有限公司 代理人 林青中
地址 710000陜西省西安市高新區(qū)新型工業(yè)園西部大道60號圓弧樓二樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及微生物鑒定領(lǐng)域，具體而言，涉及一種通過測序獲取微生物物種及相關(guān)信息的方法。該方法包括：i）獲取測序數(shù)據(jù)，所述測序數(shù)據(jù)由引物對微生物特征序列進(jìn)行擴(kuò)增后經(jīng)下一代測序技術(shù)對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測序得到；ii）將所述測序數(shù)據(jù)與特征序列數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對分析以鑒定所述待檢測樣本中的微生物組成；其中所述特征序列數(shù)據(jù)庫預(yù)先根據(jù)含有所述特征序列的參考序列的相似性做聚類處理，得到一層或多層級的cluster，每個層級cluster中有至少一個子seed，最底層的cluster中有若干作為參考序列的seed。