癌癥篩查模型、癌癥篩查模型的構(gòu)建方法及構(gòu)建裝置

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110707095.0 申請日 -
公開（公告）號 CN113257360A 公開（公告）日 2021-08-13
申請公布號 CN113257360A 申請公布日 2021-08-13
分類號 G16B40/20（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I;G16B20/20（2019.01）I;G16H50/20（2018.01）I;G16H50/70（2018.01）I;G06K9/62（2006.01）I 分類 物理
發(fā)明人 曹善柏;周濤;張萌萌;郭璟;孫宏;樓峰 申請（專利權(quán)）人 北京橡鑫生物科技有限公司
代理機構(gòu) 北京康信知識產(chǎn)權(quán)代理有限責任公司 代理人 金田蘊
地址 102600北京市大興區(qū)經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)科創(chuàng)十三街18號院5號樓16層1601
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種癌癥篩查模型、癌癥篩查模型的構(gòu)建方法及構(gòu)建裝置。該構(gòu)建方法包括以下步驟：基于不同的數(shù)據(jù)構(gòu)建不同的CNV baseline；分別利用不同的CNV baseline對待檢測樣本的sWGS數(shù)據(jù)進行CNV檢測，獲取多個基因組特征；利用待檢測樣本的sWGS數(shù)據(jù)建立訓練集與測試集，將各個基因組特征的數(shù)值做ROC曲線，選擇AUC值最大的基因組特征作為最終基因組特征；對最終基因組特征進行模型訓練，獲得癌癥篩查模型。本發(fā)明通過納入sWGS情況下，基于不同baseline數(shù)據(jù)獲得多個基因組特征，建立訓練集與測試集，通過機器學習的方法，建立癌癥篩查模型，提高癌癥（早期）篩查的準確性。