基于MALDI-TOF質譜數(shù)據(jù)鑒定細菌混合樣品的算法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201710517246.X 申請日 -
公開(公告)號 CN107271533B 公開(公告)日 2019-09-13
申請公布號 CN107271533B 申請公布日 2019-09-13
分類號 G01N27/62(2006.01)I 分類 測量;測試;
發(fā)明人 余紹寧 申請(專利權)人 浙江和譜生物科技有限公司
代理機構 杭州裕陽聯(lián)合專利代理有限公司 代理人 浙江和譜生物科技有限公司;傳鳴(寧波)化學科技有限公司
地址 310000 浙江省杭州市濱江區(qū)長河街道濱安路688號5幢15層1512室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供基于MALDI?TOF質譜數(shù)據(jù)鑒定細菌混合樣品的算法,包括以下步驟:(1)利用參考數(shù)據(jù)庫中的候選圖譜合成模擬混合圖譜;(2)評價實驗圖譜與模擬混合圖譜的相似度,選出最可能匹配結果;(3)利用“隨機圖譜模型法”計算錯誤檢出率。本發(fā)明構建的細菌混合樣品鑒定算法,實現(xiàn)混合細菌樣本的直接鑒定,避免了傳統(tǒng)方法步驟繁瑣、耗時較長的問題;引入了綜合評價樣品譜圖搜庫匹配結果的假設驗證方法,以FDR值作為鑒定的閾值,提高了基于譜圖相似度計算的搜庫匹配結果的可靠性;具有較好的綜合評價能力,具有較強的可操作性和實用性。