一種基于CRISPR-Cas9技術(shù)設(shè)計(jì)點(diǎn)突變模型的方法及系統(tǒng)
基本信息
申請?zhí)?/td> | CN202010205993.1 | 申請日 | - |
公開(公告)號 | CN111508558A | 公開(公告)日 | 2020-08-07 |
申請公布號 | CN111508558A | 申請公布日 | 2020-08-07 |
分類號 | G16B20/20 | 分類 | - |
發(fā)明人 | 高翠;黎肖容 | 申請(專利權(quán))人 | 廣州賽業(yè)百沐生物科技有限公司 |
代理機(jī)構(gòu) | 廣州嘉權(quán)專利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 | 代理人 | 廣州賽業(yè)百沐生物科技有限公司 |
地址 | 510663 廣東省廣州市黃埔區(qū)神舟路288號C棟1401房、1501房、1601房 | ||
法律狀態(tài) | - |
摘要
摘要 | 本發(fā)明公開了一種基于CRISPR?Cas9技術(shù)設(shè)計(jì)點(diǎn)突變模型的方法及系統(tǒng),方法包括:1)確定點(diǎn)突變模型動(dòng)物的突變位點(diǎn);2)根據(jù)突變信息計(jì)算突變點(diǎn)所在目標(biāo)外顯子或者突變位點(diǎn)最臨近的外顯子的編碼范圍;3)gRNA設(shè)計(jì):在突變點(diǎn)上下游50bp范圍內(nèi)設(shè)計(jì)gRNA,計(jì)算并基于gRNA的脫靶分值、gRNA序列分值、gRNA切割位置與突變點(diǎn)的相對位置分值、gRNA回切分值確定不同gRNA序列總分值,基于總分值確定候選gRNA序列;4)輸出設(shè)計(jì)方案。本發(fā)明的一些實(shí)例,可以基于現(xiàn)有的信息自動(dòng)設(shè)計(jì)出可用的點(diǎn)突變模型,大大提升了方案的質(zhì)量,提高實(shí)驗(yàn)成功率,減輕了對于熟練實(shí)驗(yàn)人員的依賴;可以篩選出效率更佳的點(diǎn)突變模型設(shè)計(jì)方案,有利于提高點(diǎn)突變模型的構(gòu)建成功率或效率。 |
