一種基于宏基因組的人腺病毒分子分型和溯源方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110082315.5 申請日 -
公開(公告)號 CN112687344A 公開(公告)日 2021-04-20
申請公布號 CN112687344A 申請公布日 2021-04-20
分類號 G16B30/00(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I;G16B50/00(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 夏涵 申請(專利權)人 西咸新區(qū)予果微碼生物科技有限公司
代理機構 北京冠和權律師事務所 代理人 吳金水
地址 100000北京市東城區(qū)和平里東街11號37號樓213-B25號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于宏基因組的人腺病毒分子分型和溯源方法及系統(tǒng),其方法包括:構建包含分型層級分類系統(tǒng)的人腺病毒分型數(shù)據(jù)庫,獲取人腺病毒的分類單元和完整基因組/標記基因序列,確定人腺病毒每個分類單元的完整基因組/標記基因序列,獲取臨床樣本的宏基因組測序原始數(shù)據(jù),對其進行預處理獲得目標宏基因組數(shù)據(jù),利用預設宏基因組測序數(shù)據(jù)雙重比對注釋系統(tǒng)分析目標宏基因組數(shù)據(jù),確定所述臨床樣本是否有目標人腺病毒分類單元,當確定臨床樣本中有目標人腺病毒分類單元時,確定目標人腺病毒分類單元對應的目標關聯(lián)特征,生成人腺病毒分型鑒定報告。能夠?qū)Σ《竞科偷呐R床感染樣本進行人腺病毒的分類單元(亞型/基因型)分型鑒定。??