一種基于宏基因組的人腺病毒分子分型和溯源方法及系統(tǒng)
基本信息
申請?zhí)?/td> | CN202110082315.5 | 申請日 | - |
公開(公告)號 | CN112687344A | 公開(公告)日 | 2021-04-20 |
申請公布號 | CN112687344A | 申請公布日 | 2021-04-20 |
分類號 | G16B30/00(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I;G16B50/00(2019.01)I | 分類 | 物理 |
發(fā)明人 | 夏涵 | 申請(專利權)人 | 西咸新區(qū)予果微碼生物科技有限公司 |
代理機構 | 北京冠和權律師事務所 | 代理人 | 吳金水 |
地址 | 100000北京市東城區(qū)和平里東街11號37號樓213-B25號 | ||
法律狀態(tài) | - |
摘要
摘要 | 本發(fā)明公開了一種基于宏基因組的人腺病毒分子分型和溯源方法及系統(tǒng),其方法包括:構建包含分型層級分類系統(tǒng)的人腺病毒分型數(shù)據(jù)庫,獲取人腺病毒的分類單元和完整基因組/標記基因序列,確定人腺病毒每個分類單元的完整基因組/標記基因序列,獲取臨床樣本的宏基因組測序原始數(shù)據(jù),對其進行預處理獲得目標宏基因組數(shù)據(jù),利用預設宏基因組測序數(shù)據(jù)雙重比對注釋系統(tǒng)分析目標宏基因組數(shù)據(jù),確定所述臨床樣本是否有目標人腺病毒分類單元,當確定臨床樣本中有目標人腺病毒分類單元時,確定目標人腺病毒分類單元對應的目標關聯(lián)特征,生成人腺病毒分型鑒定報告。能夠?qū)Σ《竞科偷呐R床感染樣本進行人腺病毒的分類單元(亞型/基因型)分型鑒定。?? |
