篩選候選插入片段的方法和系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010207885.8 申請日 -
公開（公告）號 CN113436683A 公開（公告）日 2021-09-24
申請公布號 CN113436683A 申請公布日 2021-09-24
分類號 G16B30/00（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I;C12N15/11（2006.01）I;C12N15/13（2006.01）I 分類 物理
發(fā)明人 黃慧雅;曹玉冰;劉乙齊;郭亞琨 申請（專利權(quán)）人 北京合生基因科技有限公司
代理機構(gòu) 北京清亦華知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 肖陽
地址 102206北京市昌平區(qū)中關(guān)村生命科學(xué)園創(chuàng)新大廈B203室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提出了一種篩選候選插入片段的方法，所述插入片段用于改造待測樣本核酸序列。該方法包括：基于用于改造待測樣本核酸序列的候選基因，確定初始基因編碼區(qū)序列；對所述初始基因編碼區(qū)序列進行同義密碼子替換，以便獲得由多個候選編碼區(qū)序列構(gòu)成的候選編碼區(qū)序列集合；將所述候選編碼區(qū)序列與自身、宿主基因組和病毒基因組進行比對，并確定同源性高風(fēng)險區(qū)域，以便對所述候選編碼區(qū)序列進行同源性風(fēng)險評分；和基于所述同源性風(fēng)險評分，在所述候選編碼區(qū)序列集合中確定優(yōu)選編碼區(qū)序列子集。