一種高密度遺傳圖譜的構(gòu)建方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN201710804279.2 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN107644150B | 公開(kāi)（公告）日 | 2021-03-19 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN107644150B | 申請(qǐng)公布日 | 2021-03-19 |
| 分類(lèi)號(hào) | G16B40/00(2019.01)I;G16B20/20(2019.01)I | 分類(lèi) | 物理 |
| 發(fā)明人 | 蔡慶樂(lè);唐耀華;何榮軍 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 杭州和壹基因科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 杭州中成專(zhuān)利事務(wù)所有限公司 | 代理人 | 唐銀益 |
| 地址 | 310051浙江省杭州市濱江區(qū)長(zhǎng)河街道聚才路88號(hào)遠(yuǎn)方科技中心15樓 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供了一種高密度遺傳圖譜的構(gòu)建方法，步驟是1)根據(jù)遺傳分離群體高通量測(cè)序數(shù)據(jù)中得到的SNP標(biāo)記，對(duì)標(biāo)記進(jìn)行基因型分型和過(guò)濾，再計(jì)算兩兩之間的重組率；2)利用步驟1)算得的重組率，采用分層聚類(lèi)算法根據(jù)前述遺傳分離群體的染色體數(shù)對(duì)SNP標(biāo)記進(jìn)行分組，得到與染色體數(shù)對(duì)應(yīng)的連鎖群；3)采用最小生成樹(shù)算法對(duì)標(biāo)記進(jìn)行排序，對(duì)排序后的SNP標(biāo)記進(jìn)行補(bǔ)缺失和糾錯(cuò)處理，最后計(jì)算遺傳距離得到遺傳圖譜。本發(fā)明針對(duì)不同的遺傳分離群體高效、高準(zhǔn)確率的構(gòu)建遺傳圖譜，為后續(xù)的生物信息學(xué)分析和遺傳學(xué)研究提供有力支持。?? |
