一種基于宏基因組的人腺病毒分子分型和溯源方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110082315.5 申請日 -
公開（公告）號 CN112687344B 公開（公告）日 2021-09-10
申請公布號 CN112687344B 申請公布日 2021-09-10
分類號 G16B50/00;G16B30/00;G16B40/00 分類 物理
發(fā)明人 夏涵 申請（專利權）人 予果生物科技（北京）有限公司
代理機構 北京冠和權律師事務所 代理人 吳金水
地址 100000 北京市東城區(qū)和平里東街11號37號樓213-B25號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于宏基因組的人腺病毒分子分型和溯源方法及系統(tǒng)，其方法包括：構建包含分型層級分類系統(tǒng)的人腺病毒分型數(shù)據(jù)庫，獲取人腺病毒的分類單元和完整基因組/標記基因序列，確定人腺病毒每個分類單元的完整基因組/標記基因序列，獲取臨床樣本的宏基因組測序原始數(shù)據(jù)，對其進行預處理獲得目標宏基因組數(shù)據(jù)，利用預設宏基因組測序數(shù)據(jù)雙重比對注釋系統(tǒng)分析目標宏基因組數(shù)據(jù)，確定所述臨床樣本是否有目標人腺病毒分類單元，當確定臨床樣本中有目標人腺病毒分類單元時，確定目標人腺病毒分類單元對應的目標關聯(lián)特征，生成人腺病毒分型鑒定報告。能夠對病毒含量偏低的臨床感染樣本進行人腺病毒的分類單元(亞型/基因型)分型鑒定。