一種基于宏基因組的人腺病毒分子分型和溯源方法及系統(tǒng)
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202110082315.5 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開（公告）號(hào) | CN112687344A | 公開（公告）日 | 2021-04-20 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN112687344A | 申請(qǐng)公布日 | 2021-04-20 |
| 分類號(hào) | G16B30/00(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I;G16B50/00(2019.01)I | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 夏涵 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 予果生物科技（北京）有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京冠和權(quán)律師事務(wù)所 | 代理人 | 吳金水 |
| 地址 | 100000北京市東城區(qū)和平里東街11號(hào)37號(hào)樓213-B25號(hào) | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開了一種基于宏基因組的人腺病毒分子分型和溯源方法及系統(tǒng)，其方法包括：構(gòu)建包含分型層級(jí)分類系統(tǒng)的人腺病毒分型數(shù)據(jù)庫，獲取人腺病毒的分類單元和完整基因組/標(biāo)記基因序列，確定人腺病毒每個(gè)分類單元的完整基因組/標(biāo)記基因序列，獲取臨床樣本的宏基因組測(cè)序原始數(shù)據(jù)，對(duì)其進(jìn)行預(yù)處理獲得目標(biāo)宏基因組數(shù)據(jù)，利用預(yù)設(shè)宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)雙重比對(duì)注釋系統(tǒng)分析目標(biāo)宏基因組數(shù)據(jù)，確定所述臨床樣本是否有目標(biāo)人腺病毒分類單元，當(dāng)確定臨床樣本中有目標(biāo)人腺病毒分類單元時(shí)，確定目標(biāo)人腺病毒分類單元對(duì)應(yīng)的目標(biāo)關(guān)聯(lián)特征，生成人腺病毒分型鑒定報(bào)告。能夠?qū)Σ《竞科偷呐R床感染樣本進(jìn)行人腺病毒的分類單元(亞型/基因型)分型鑒定。?? |
