基于宏基因組的臨床重要致病菌毒力基因檢測的方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110579642.1 申請日 -
公開（公告）號 CN113223618A 公開（公告）日 2021-08-06
申請公布號 CN113223618A 申請公布日 2021-08-06
分類號 G16B30/10;G16B40/00;G16B50/10 分類 物理
發(fā)明人 夏涵;官遠(yuǎn)林;江月;樊淑;楊靜;胡煜 申請（專利權(quán)）人 予果生物科技（北京）有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京冠和權(quán)律師事務(wù)所 代理人 趙銀萍
地址 100000 北京市東城區(qū)和平里東街11號37號樓213-B25號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于宏基因組的臨床重要致病菌毒力基因檢測的方法和系統(tǒng)。該方法包括：S10，建立臨床致病菌毒力基因數(shù)據(jù)庫；S20，獲取臨床樣本宏基因組測序原始數(shù)據(jù)，對其預(yù)處理獲得目標(biāo)數(shù)據(jù)；S30，利用預(yù)設(shè)宏基因組測序數(shù)據(jù)多重比對注釋系統(tǒng)分析目標(biāo)數(shù)據(jù)，鑒定毒力基因；S40，建立重要毒力基因?毒力因子?表征(功能/臨床表型)關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫；S50，利用預(yù)設(shè)臨床自動化報(bào)告系統(tǒng)，基于毒力基因鑒定結(jié)果和關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫，生成毒力基因鑒定報(bào)告。該系統(tǒng)能夠?qū)Σ煌愋?腦脊液等)的臨床感染樣本的宏基因組測序數(shù)據(jù)進(jìn)行毒力基因鑒定，一次性鑒定樣本中多種病原菌的多個重要毒力基因，具有較好的靈敏性和準(zhǔn)確性，幫助醫(yī)生及時進(jìn)行診斷、治療和預(yù)后。