一種鑒別東北地區(qū)黃芩的SSR分子標記引物及方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202011048452.9 申請日 -
公開(公告)號 CN113684291A 公開(公告)日 2021-11-23
申請公布號 CN113684291A 申請公布日 2021-11-23
分類號 C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 分類 生物化學;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物學;酶學;突變或遺傳工程;
發(fā)明人 王繼永;鄭司浩;曾燕;劉美娟;尚興樸;梁煥;趙莎;王浩;李九如;高強;靜一;劉國城;孫文靜 申請(專利權)人 中國中藥有限公司
代理機構 北京知聯(lián)天下知識產權代理事務所(普通合伙) 代理人 張陸軍;張迎新
地址 100195 北京市海淀區(qū)西四環(huán)北路15號依斯特大廈8層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種鑒別東北地區(qū)黃芩的SSR分子標記引物及方法,方法包括如下步驟:以待鑒定黃芩樣本的總DNA為模板,用SSR分子標記引物進行PCR擴增,得到擴增產物;對擴增產物進行毛細管電泳測序分型,得到擴增產物的分型結果;將擴增產物的分型結果用GeneMarker4.0進行峰圖判讀,得到等位基因矩陣;根據(jù)等位基因矩陣,通過GenALEx計算黃芩的遺傳多樣性數(shù)據(jù);基于GenALEx計算所得的遺傳多樣性數(shù)據(jù),通過MEGA進行UPGMA聚類分析,構建聚類樹。本發(fā)明應用基因組技術及SSR分子標記技術,利用黃芩基因組設計SSR引物,并通過河北、山西、山東、陜西、內蒙古、遼寧、吉林等地的黃芩樣本篩選SSR引物,用于特異性鑒別東北地區(qū)黃芩樣本,準確度高、穩(wěn)定性強、易于大范圍推廣應用。