用于在基因芯片中將外顯子探針信號值轉(zhuǎn)化為轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)與濃度的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201310284395.8 申請日 -
公開（公告）號 CN104112083A 公開（公告）日 2016-11-09
申請公布號 CN104112083A 申請公布日 2016-11-09
分類號 G06F19/16 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 王效智;李奇 申請（專利權(quán)）人 上海其明信息技術(shù)有限公司
代理機構(gòu) 北京金信立方知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 劉鋒;黃小棟
地址 201210 上海市浦東新區(qū)張江路665號907室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種用于在基因芯片中將外顯子探針信號值轉(zhuǎn)化為轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)與濃度的方法，包括以下步驟：S100，對該多個探針的初始信號值進(jìn)行處理，獲得轉(zhuǎn)錄本和探針的初始結(jié)構(gòu)關(guān)系矩陣以及轉(zhuǎn)錄本和樣本的初始濃度關(guān)系矩陣；S200，從已知轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)庫中分別選取與該初始結(jié)構(gòu)關(guān)系矩陣內(nèi)該每個結(jié)構(gòu)關(guān)系數(shù)列階梯距離最短的最小階梯距離標(biāo)準(zhǔn)數(shù)列；S300，確定各該結(jié)構(gòu)關(guān)系數(shù)列的最近似標(biāo)準(zhǔn)數(shù)列；S400，根據(jù)各該結(jié)構(gòu)關(guān)系數(shù)列的最近似標(biāo)準(zhǔn)數(shù)列，將該初始濃度關(guān)系矩陣調(diào)整為最終的預(yù)測濃度關(guān)系矩陣。通過本發(fā)明得出的轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)和濃度與實驗驗證結(jié)果具有很好的一致性，并可為后續(xù)試驗提供可靠參考。