一種基因組瘢痕模型的建立方法
基本信息
申請?zhí)?/td> | CN202010932026.5 | 申請日 | - |
公開(公告)號 | CN112164420B | 公開(公告)日 | 2021-07-20 |
申請公布號 | CN112164420B | 申請公布日 | 2021-07-20 |
分類號 | G16B20/20;G16H50/50 | 分類 | 物理 |
發(fā)明人 | 楊爽;董華;陳學俊;胡靖;黃紅偉;鄭方克;鄭立謀 | 申請(專利權)人 | 廈門艾德生物醫(yī)藥科技股份有限公司 |
代理機構 | 廈門市首創(chuàng)君合專利事務所有限公司 | 代理人 | 張松亭;姜謐 |
地址 | 361000 福建省廈門市海滄區(qū)鼎山路39號 | ||
法律狀態(tài) | - |
摘要
摘要 | 本發(fā)明公開了一種基因組瘢痕模型的建立方法及其應用,包括:(1)收集已知的陽性樣本和陰性樣本,組成訓練集;(2)對上述訓練集中的CNV的情況進行分析,確定CNV的類型及相應的數(shù)量;(3)確定BRCAness陽性事件和BRCAness陰性事件;(4)通過機器學習方法,根據(jù)訓練集中的BRCAness陽性事件、BRCAness陰性事件,訓練獲得步驟(2)所確定的不同類型的CNV的權重,然后將不同類型的CNV帶權重累加,得到用以計算GSS的基因組瘢痕模型。本發(fā)明可以準確預測待測樣本BRCAness狀態(tài),并可以根據(jù)基因組瘢痕分數(shù)直接給出判讀結果。 |
