一種基于糞便微生物標志物和人DNA含量的結(jié)直腸癌風險評估的方法及應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010118005.X 申請日 -
公開（公告）號 CN113314211A 公開（公告）日 2021-08-27
申請公布號 CN113314211A 申請公布日 2021-08-27
分類號 G16H50/20（2018.01）I;G16H50/30（2018.01）I;G16B40/00（2019.01）I;G16B30/00（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 陳衛(wèi)華;江浦滋;羅奇斌 申請（專利權(quán)）人 深圳市奇云生物信息科技有限公司
代理機構(gòu) - 代理人 -
地址 518055廣東省深圳市南山區(qū)西麗街道辦牛城路217號-26
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及醫(yī)療篩查領(lǐng)域，且公開了一種基于糞便微生物標志物和人DNA含量的結(jié)直腸癌風險評估的方法及應(yīng)用，包括人體腸道微生物在線數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建、數(shù)據(jù)預(yù)處理、相關(guān)通路豐度鑒定、機器學(xué)習模型的建立、真實樣本應(yīng)用。以相關(guān)DNA含量作為衡量對象，增加測量的全面性，同時利用多個數(shù)據(jù)集通過薈萃（Meta）分析，所得到的差異菌群、差異通路具有很強的跨人種適用性，除了根據(jù)微生物群落的變化，還可以根據(jù)代謝網(wǎng)絡(luò)的變化來預(yù)測受試者腸道健康狀況，并通過機器學(xué)習模型對腸道微生物和糞便中人類DNA含量進行計算，使得整個流程更加實用和精確，保證計算結(jié)果的準確性，該綜合糞便人類DNA信息與糞便菌群標志物的預(yù)測風險模型，只需要采糞便樣本并進行宏基因組測序就可以得到兩者的信息，而不需要結(jié)合其他檢測，依存性強，同時所選取的實驗載體糞便是臨床使用和體檢機構(gòu)中最常見的，獲取難度小成本低，解釋程度高。