一種微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建方法及系統(tǒng)
基本信息
申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202111443169.0 | 申請(qǐng)日 | - |
公開(kāi)(公告)號(hào) | CN114121167B | 公開(kāi)(公告)日 | 2022-07-01 |
申請(qǐng)公布號(hào) | CN114121167B | 申請(qǐng)公布日 | 2022-07-01 |
分類(lèi)號(hào) | G16B50/30(2019.01)I;G16B50/10(2019.01)I | 分類(lèi) | 物理 |
發(fā)明人 | 徐曉強(qiáng);夏炎;王曉凱;謝海亮 | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人 | 深圳零一生命科技有限責(zé)任公司 |
代理機(jī)構(gòu) | 杭州信與義專(zhuān)利代理有限公司 | 代理人 | - |
地址 | 518000廣東省深圳市寶安區(qū)福永云創(chuàng)孵化器26棟3層 | ||
法律狀態(tài) | - |
摘要
摘要 | 本發(fā)明公開(kāi)了一種微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建方法及系統(tǒng),屬于基因數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建技術(shù)領(lǐng)域。所述方法包括以下步驟:獲取目標(biāo)微生物基因組數(shù)據(jù),對(duì)獲取的基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行基因預(yù)測(cè),獲得包含序列和物種注釋的基因注釋文件;獲得每種目標(biāo)微生物的代表基因;將所述代表基因中的每個(gè)基因分別比對(duì)到核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù),獲得比對(duì)結(jié)果;過(guò)濾比對(duì)結(jié)果,獲得基因注釋物種信息,保留注釋物種與來(lái)源物種相同的基因,進(jìn)而構(gòu)建所述微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)。利用本發(fā)明的構(gòu)建方法構(gòu)建微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù),可以根據(jù)目標(biāo)微生物的變化對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行更新,實(shí)時(shí)性更強(qiáng),利用本發(fā)明構(gòu)建的微生物數(shù)據(jù)庫(kù),僅包含目標(biāo)微生物基因序列,對(duì)比時(shí)間更短。 |
