一種微生物基因數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202111443169.0 申請日 -
公開（公告）號 CN114121167A 公開（公告）日 2022-03-01
申請公布號 CN114121167A 申請公布日 2022-03-01
分類號 G16B50/30（2019.01）I;G16B50/10（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 徐曉強;夏炎;王曉凱;謝海亮 申請（專利權(quán)）人 深圳零一生命科技有限責任公司
代理機構(gòu) 杭州信與義專利代理有限公司 代理人 萬景旺
地址 518000廣東省深圳市寶安區(qū)福永云創(chuàng)孵化器26棟3層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種微生物基因數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建方法及系統(tǒng)，屬于基因數(shù)據(jù)庫構(gòu)建技術(shù)領(lǐng)域。所述方法包括以下步驟：獲取目標微生物基因組數(shù)據(jù)，對獲取的基因組數(shù)據(jù)進行基因預測，獲得包含序列和物種注釋的基因注釋文件；獲得每種目標微生物的代表基因；將所述代表基因中的每個基因分別比對到核酸序列數(shù)據(jù)庫，獲得比對結(jié)果；過濾比對結(jié)果，獲得基因注釋物種信息，保留注釋物種與來源物種相同的基因，進而構(gòu)建所述微生物基因數(shù)據(jù)庫。利用本發(fā)明的構(gòu)建方法構(gòu)建微生物基因數(shù)據(jù)庫，可以根據(jù)目標微生物的變化對數(shù)據(jù)庫進行更新，實時性更強，利用本發(fā)明構(gòu)建的微生物數(shù)據(jù)庫，僅包含目標微生物基因序列，對比時間更短。