一種無參考基因組的群體變異檢測分析方法
基本信息
| 申請?zhí)?/td> | CN202011596548.9 | 申請日 | - |
| 公開（公告）號 | CN112735516A | 公開（公告）日 | 2021-04-30 |
| 申請公布號 | CN112735516A | 申請公布日 | 2021-04-30 |
| 分類號 | G16B20/20;G16B40/00 | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 徐昊;姜麗榮;孫子奎 | 申請（專利權(quán)）人 | 上海派森諾生物科技股份有限公司 |
| 代理機構(gòu) | 上海點威知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 | 代理人 | 胡志強 |
| 地址 | 200030 上海市徐匯區(qū)銀都路218號2號樓3、4層 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開了一種無參考基因組的群體變異檢測分析方法，1)通過dd?RAD的方法進行樣本測序，測序后得到每個樣本的數(shù)據(jù)使用flash軟件包將有overlap的read1與read2連接起來，通過聚類軟件對每個樣本的序列聚類，提取每個樣本序列中的consensus序列；2)將步驟1)得到的每個樣本序列的consensus序列合并，然后進行聚類，過濾，得到群體的consensus序列，通過本發(fā)明使無參考基因組的群體進化分析更加高效，可以極大提高變異檢測的速度和準(zhǔn)確度。 |
