一種用于鑒定樣品中幽門螺桿菌的細菌分型和耐藥類型的二代測序建庫方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910751812.2 申請日 -
公開(公告)號 CN110453000A 公開(公告)日 2019-11-15
申請公布號 CN110453000A 申請公布日 2019-11-15
分類號 C12Q1/689;C12Q1/6806;C40B50/06 分類 生物化學(xué);啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物學(xué);酶學(xué);突變或遺傳工程;
發(fā)明人 覃俊杰 申請(專利權(quán))人 深圳譜元科技有限公司
代理機構(gòu) 深圳市精英專利事務(wù)所 代理人 李翔宇
地址 518000廣東省深圳市福田區(qū)福保街道福保社區(qū)市花路南側(cè)長富金茂大廈1號樓2103
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種用于鑒定樣品中幽門螺桿菌的細菌分型和耐藥類型的二代測序建庫方法,包括步驟S1,引物的設(shè)計和篩選,根據(jù)待測靶基因設(shè)計特異性引物;步驟S2,合成通用引物對;步驟S3,合成過渡性引物對;步驟S4,合成建庫引物對;步驟S5,基因組的提?。徊襟ES6,在PCR擴增體系中加入所有的特異性引物對進行第一輪的多重擴增,回收產(chǎn)物并稀釋,作為下一輪多重擴增的模板;步驟S7,在PCR擴增體系中加入通用引物對和所有的過渡性引物對進行第二輪的多重擴增,回收產(chǎn)物并稀釋,作為下一輪多重擴增的模板;步驟S8,在PCR擴增體系中加入建庫引物對進行第三輪的建庫擴增,回收產(chǎn)物,獲得制備完畢的文庫;步驟S9,NGS靶基因測序;步驟S10,NGS分析。