一種用于鑒定樣品中幽門螺桿菌的細(xì)菌分型和耐藥類型的二代測(cè)序建庫方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201910751812.2 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN110453000A 公開（公告）日 2019-11-15
申請(qǐng)公布號(hào) CN110453000A 申請(qǐng)公布日 2019-11-15
分類號(hào) C12Q1/689;C12Q1/6806;C40B50/06 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 覃俊杰 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 深圳譜元科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 深圳市精英專利事務(wù)所 代理人 李翔宇
地址 518000廣東省深圳市福田區(qū)福保街道福保社區(qū)市花路南側(cè)長(zhǎng)富金茂大廈1號(hào)樓2103
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種用于鑒定樣品中幽門螺桿菌的細(xì)菌分型和耐藥類型的二代測(cè)序建庫方法，包括步驟S1，引物的設(shè)計(jì)和篩選，根據(jù)待測(cè)靶基因設(shè)計(jì)特異性引物；步驟S2，合成通用引物對(duì)；步驟S3，合成過渡性引物對(duì)；步驟S4，合成建庫引物對(duì)；步驟S5，基因組的提?。徊襟ES6，在PCR擴(kuò)增體系中加入所有的特異性引物對(duì)進(jìn)行第一輪的多重?cái)U(kuò)增，回收產(chǎn)物并稀釋，作為下一輪多重?cái)U(kuò)增的模板；步驟S7，在PCR擴(kuò)增體系中加入通用引物對(duì)和所有的過渡性引物對(duì)進(jìn)行第二輪的多重?cái)U(kuò)增，回收產(chǎn)物并稀釋，作為下一輪多重?cái)U(kuò)增的模板；步驟S8，在PCR擴(kuò)增體系中加入建庫引物對(duì)進(jìn)行第三輪的建庫擴(kuò)增，回收產(chǎn)物，獲得制備完畢的文庫；步驟S9，NGS靶基因測(cè)序；步驟S10，NGS分析。