一種基于SOLID測序技術(shù)的基因SNP位點(diǎn)檢測方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201310351267.0 申請日 -
公開（公告）號 CN103451279B 公開（公告）日 2015-02-18
申請公布號 CN103451279B 申請公布日 2015-02-18
分類號 C12Q1/68(2006.01)I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 鄧彥;王月蘭;倪受庸;劉新華 申請（專利權(quán)）人 北京華生恒業(yè)科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) - 代理人 -
地址 224007 江蘇省鹽城市經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)希望大道南路5號4幢14樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明屬于生物工程領(lǐng)域，尤其涉及一種基于SOLiD測序的SNP位點(diǎn)檢測方法。其具體步驟如下：（1）通過SOLiD測序獲得待測基因樣本的顏色序列；（2）預(yù)備參考序的顏色序列；（3）制備顏色編碼參考序的索引表以備快速定位樣本序；（4）將SOLID測序樣本序和顏色編碼參考序進(jìn)行比對，找出樣本序在參考序中的最佳匹配位置；比對樣本序與參考序，獲取顏色編碼匹配信息；（5）根據(jù)顏色編碼的匹配信息，分析SOLiD樣本序與顏色編碼的參考序的堿基匹配信息，確定不確定變異點(diǎn)；（6）統(tǒng)計(jì)獲得的不確定變異點(diǎn)，去除噪聲和測序錯(cuò)誤導(dǎo)致的不確定變異點(diǎn)，從而獲得樣本SNP位點(diǎn)。采用本發(fā)明的SNP檢測方法，既保持了SOLID數(shù)據(jù)在比對過程中定位準(zhǔn)確度高的特性，又提高了分析SNP方法的準(zhǔn)確度。