一種基于單細胞測序數(shù)據(jù)唯一片段序列捕獲方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202011200039.X 申請日 -
公開（公告）號 CN112309500A 公開（公告）日 2021-02-02
申請公布號 CN112309500A 申請公布日 2021-02-02
分類號 G16B30/00(2019.01)I; 分類 物理
發(fā)明人 潘星華;林貫川;黃仲曦;章建平 申請（專利權）人 廣州序科碼生物技術有限責任公司
代理機構 廣州三環(huán)專利商標代理有限公司 代理人 顏希文
地址 510530廣東省廣州市高新技術產業(yè)開發(fā)區(qū)科學城開源大道11號B3棟905室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種基于單細胞測序數(shù)據(jù)捕獲唯一片段序列的方法，其特征在于，包括以下步驟：基于單細胞測序文庫中的DNA片段，以DNA片段上前10bp?20bp堿基作為識別序列，對含有相同所述識別序列的DNA片段進行歸類，通過計算機軟件將同類型的DNA片段生成一個數(shù)據(jù)集，從該數(shù)據(jù)集獲得用于分析單細胞全基因組唯一序列。本發(fā)明使用生物信息學手段進行數(shù)據(jù)識別，使得在基因組建庫過程中無需設計和通過實驗插入含有UMI的固有接頭序列，簡化了單細胞測序過程，并縮短了時間和降低因接頭序列過長所導致的引物二聚體形成的發(fā)生概率。本方法在測序數(shù)據(jù)分析之前即可去除重復的序列，對于拷貝數(shù)變異分析而言，無其它相同的序列混雜，只剩下唯一的序列片段，即可更忠實的反應基因組的情況。??