一種基因組測序數(shù)據(jù)序列組裝方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201410177319.1 申請日 -
公開（公告）號 CN104751015B 公開（公告）日 2017-08-29
申請公布號 CN104751015B 申請公布日 2017-08-29
分類號 G06F19/18(2011.01)I 分類 計(jì)算；推算；計(jì)數(shù);
發(fā)明人 孫際賓;李澎鵬;鄭平;馬延和 申請（專利權(quán)）人 天工生物科技（天津）有限公司
代理機(jī)構(gòu) 天津?yàn)I?？凭曋R產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 韓敏
地址 300308 天津市濱海新區(qū)自貿(mào)試驗(yàn)區(qū)（空港經(jīng)濟(jì)區(qū)）中環(huán)西路86號匯盈產(chǎn)業(yè)園8號樓1-201-A218
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明實(shí)施例提供了一種基因組測序數(shù)據(jù)序列組裝方法，可以簡便而準(zhǔn)確地實(shí)現(xiàn)基因組測序數(shù)據(jù)序列的組裝。該方法包括：根據(jù)序列片段之間的重疊關(guān)系，構(gòu)建重疊關(guān)系圖G以及反向互補(bǔ)圖G’；任取重疊關(guān)系圖G中的未被檢查過的節(jié)點(diǎn)nx，以任意方向D遍歷G和G’；判斷任意方向D中是否存在一節(jié)點(diǎn)ny與節(jié)點(diǎn)nx有連接關(guān)系；如果存在，則繼續(xù)判斷在方向D中的節(jié)點(diǎn)ny與節(jié)點(diǎn)nx是否為雙向唯一關(guān)系；當(dāng)所述節(jié)點(diǎn)ny與節(jié)點(diǎn)nx為雙向唯一關(guān)系時(shí)，將所述節(jié)點(diǎn)ny與nx的關(guān)系判定為可信連接關(guān)系；否則，將所述節(jié)點(diǎn)ny與nx的所有關(guān)系判定為不確認(rèn)連接關(guān)系。