一種基因組測序數(shù)據(jù)序列組裝方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201410177319.1 申請日 -
公開（公告）號 CN104751015B 公開（公告）日 2017-08-29
申請公布號 CN104751015B 申請公布日 2017-08-29
分類號 G06F19/18(2011.01)I 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 孫際賓;李澎鵬;鄭平;馬延和 申請（專利權）人 天工生物科技（天津）有限公司
代理機構 天津濱?？凭曋R產(chǎn)權代理有限公司 代理人 韓敏
地址 300308 天津市濱海新區(qū)自貿試驗區(qū)（空港經(jīng)濟區(qū)）中環(huán)西路86號匯盈產(chǎn)業(yè)園8號樓1-201-A218
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明實施例提供了一種基因組測序數(shù)據(jù)序列組裝方法，可以簡便而準確地實現(xiàn)基因組測序數(shù)據(jù)序列的組裝。該方法包括：根據(jù)序列片段之間的重疊關系，構建重疊關系圖G以及反向互補圖G’；任取重疊關系圖G中的未被檢查過的節(jié)點nx，以任意方向D遍歷G和G’；判斷任意方向D中是否存在一節(jié)點ny與節(jié)點nx有連接關系；如果存在，則繼續(xù)判斷在方向D中的節(jié)點ny與節(jié)點nx是否為雙向唯一關系；當所述節(jié)點ny與節(jié)點nx為雙向唯一關系時，將所述節(jié)點ny與nx的關系判定為可信連接關系；否則，將所述節(jié)點ny與nx的所有關系判定為不確認連接關系。