一種ctDNA測序標簽接頭、文庫、檢測方法和試劑盒

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110458794.6 申請日 -
公開（公告）號 CN113373524A 公開（公告）日 2021-09-10
申請公布號 CN113373524A 申請公布日 2021-09-10
分類號 C40B70/00（2006.01）I;C40B80/00（2006.01）I;C40B40/06（2006.01）I;C12Q1/6869（2018.01）I;G16B30/00（2019.01）I 分類 組合技術〔8〕;
發(fā)明人 邵陽;吳雪;汪笑男;常志力;包華;張秀艷 申請（專利權(quán)）人 南京世和基因生物技術股份有限公司
代理機構(gòu) 南京正聯(lián)知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 鄧唯
地址 210032江蘇省南京市高新開發(fā)區(qū)新錦湖路3-1號中丹生態(tài)生命科學產(chǎn)業(yè)園02棟18樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開一種利用NGS技術檢測血漿ctDNA超低頻突變的測序方法及分子標簽接頭。標簽接頭包括含有11個堿基的樣本標簽和含有4個堿基的單分子及雙鏈DNA共用標簽序列。樣本標簽實現(xiàn)了超過300種i7/i5“雙端唯一”index組合，分子標簽可同時用作單分子和雙鏈分子index。采用本發(fā)明提供的標簽接頭，可以有效去除文庫富集過程中DNA氧化應激損傷、PCR擴增以及測序引入的隨機錯誤突變；同時能夠有效識別發(fā)生“標簽跳躍”的分子，避免因標簽跳躍造成樣本間交叉污染引入的假性突變。本發(fā)明在保證100%特異性的前提下實現(xiàn)了檢測靈敏度的大力提升，ctDNA中豐度0.1%突變的檢測敏感性達到95%以上。