一種ctDNA測(cè)序標(biāo)簽接頭、文庫(kù)、檢測(cè)方法和試劑盒

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110458794.6 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN113373524A 公開（公告）日 2021-09-10
申請(qǐng)公布號(hào) CN113373524A 申請(qǐng)公布日 2021-09-10
分類號(hào) C40B70/00（2006.01）I;C40B80/00（2006.01）I;C40B40/06（2006.01）I;C12Q1/6869（2018.01）I;G16B30/00（2019.01）I 分類 組合技術(shù)〔8〕;
發(fā)明人 邵陽(yáng);吳雪;汪笑男;常志力;包華;張秀艷 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 南京世和基因生物技術(shù)股份有限公司
代理機(jī)構(gòu) 南京正聯(lián)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 鄧唯
地址 210032江蘇省南京市高新開發(fā)區(qū)新錦湖路3-1號(hào)中丹生態(tài)生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)園02棟18樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開一種利用NGS技術(shù)檢測(cè)血漿ctDNA超低頻突變的測(cè)序方法及分子標(biāo)簽接頭。標(biāo)簽接頭包括含有11個(gè)堿基的樣本標(biāo)簽和含有4個(gè)堿基的單分子及雙鏈DNA共用標(biāo)簽序列。樣本標(biāo)簽實(shí)現(xiàn)了超過(guò)300種i7/i5“雙端唯一”index組合，分子標(biāo)簽可同時(shí)用作單分子和雙鏈分子index。采用本發(fā)明提供的標(biāo)簽接頭，可以有效去除文庫(kù)富集過(guò)程中DNA氧化應(yīng)激損傷、PCR擴(kuò)增以及測(cè)序引入的隨機(jī)錯(cuò)誤突變；同時(shí)能夠有效識(shí)別發(fā)生“標(biāo)簽跳躍”的分子，避免因標(biāo)簽跳躍造成樣本間交叉污染引入的假性突變。本發(fā)明在保證100%特異性的前提下實(shí)現(xiàn)了檢測(cè)靈敏度的大力提升，ctDNA中豐度0.1%突變的檢測(cè)敏感性達(dá)到95%以上。