一種NGS測(cè)序中樣本質(zhì)量預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng)

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110757007.8 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN113528631A 公開（公告）日 2021-10-22
申請(qǐng)公布號(hào) CN113528631A 申請(qǐng)公布日 2021-10-22
分類號(hào) C12Q1/6869（2018.01）I;G16B5/00（2019.01）I;G16B25/20（2019.01）I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 何俊俊;邵陽(yáng);劉凱華;朱偉;高宇;楊嵐;汪笑男;王曉丹;焦樂晨;趙瑾 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 南京世和基因生物技術(shù)股份有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京眾合誠(chéng)成知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 鄒仕娟
地址 210032江蘇省南京市高新開發(fā)區(qū)新錦湖路3-1號(hào)中丹生態(tài)生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)園02棟18樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及一種通過腫瘤組織樣本NGS前期實(shí)驗(yàn)指標(biāo)預(yù)測(cè)質(zhì)控是否合格的模型和軟件，屬于臨床檢驗(yàn)學(xué)和生物技術(shù)領(lǐng)域。通過提取和預(yù)文庫(kù)構(gòu)建過程第一天的實(shí)驗(yàn)指標(biāo)，篩選出與質(zhì)控相關(guān)的因素，通過嶺回歸的方法，以NGS實(shí)驗(yàn)流程前期的指標(biāo)建立NGS質(zhì)控預(yù)測(cè)模型。對(duì)于預(yù)測(cè)為質(zhì)控不合格的樣本及時(shí)告知患者，有效的解決患者測(cè)序生信分析后才知道自己樣本不合格再重新準(zhǔn)備的問題。將模型通過PYTHON編譯并打包成小軟件，實(shí)驗(yàn)員通過界面輸入相關(guān)實(shí)驗(yàn)指標(biāo)來預(yù)測(cè)該樣本質(zhì)控是否合格，適用于預(yù)測(cè)樣本測(cè)序后的質(zhì)控風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。