一種NGS測序中樣本質(zhì)量預(yù)測方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110757007.8 申請日 -
公開（公告）號 CN113528631A 公開（公告）日 2021-10-22
申請公布號 CN113528631A 申請公布日 2021-10-22
分類號 C12Q1/6869（2018.01）I;G16B5/00（2019.01）I;G16B25/20（2019.01）I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 何俊俊;邵陽;劉凱華;朱偉;高宇;楊嵐;汪笑男;王曉丹;焦樂晨;趙瑾 申請（專利權(quán)）人 南京世和基因生物技術(shù)股份有限公司
代理機構(gòu) 北京眾合誠成知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 鄒仕娟
地址 210032江蘇省南京市高新開發(fā)區(qū)新錦湖路3-1號中丹生態(tài)生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)園02棟18樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及一種通過腫瘤組織樣本NGS前期實驗指標(biāo)預(yù)測質(zhì)控是否合格的模型和軟件，屬于臨床檢驗學(xué)和生物技術(shù)領(lǐng)域。通過提取和預(yù)文庫構(gòu)建過程第一天的實驗指標(biāo)，篩選出與質(zhì)控相關(guān)的因素，通過嶺回歸的方法，以NGS實驗流程前期的指標(biāo)建立NGS質(zhì)控預(yù)測模型。對于預(yù)測為質(zhì)控不合格的樣本及時告知患者，有效的解決患者測序生信分析后才知道自己樣本不合格再重新準備的問題。將模型通過PYTHON編譯并打包成小軟件，實驗員通過界面輸入相關(guān)實驗指標(biāo)來預(yù)測該樣本質(zhì)控是否合格，適用于預(yù)測樣本測序后的質(zhì)控風(fēng)險評估。