一種基于高性能計(jì)算平臺(tái)的核酸適配體計(jì)算機(jī)輔助篩選方法及核酸適配體
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN201910379241.4 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN110111849B | 公開(kāi)（公告）日 | 2021-03-26 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN110111849B | 申請(qǐng)公布日 | 2021-03-26 |
| 分類(lèi)號(hào) | G16B50/00(2019.01)I;G16B30/00(2019.01)I | 分類(lèi) | 物理 |
| 發(fā)明人 | 劉彤;屈鋒;裴智勇;劉書(shū)霞;陸曉娟;劉滿(mǎn)姣;袁寒玉;楊杰 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 北京市計(jì)算中心有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | - | 代理人 | - |
| 地址 | 100094北京市東城區(qū)東四南大街249號(hào) | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供了一種基于高性能計(jì)算平臺(tái)的核酸適配體計(jì)算機(jī)輔助篩選方法，涉及分子生物學(xué)檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域，根據(jù)匹配原則查詢(xún)篩選平臺(tái)集成的數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)中是否有與目標(biāo)蛋白匹配的蛋白結(jié)構(gòu)，如果有則作為受體模板，如果沒(méi)有則進(jìn)行同源構(gòu)建，通過(guò)分子動(dòng)力學(xué)模擬和分子對(duì)接篩選得到初選的核酸適配體，最為核酸適配體候選物，具有高效、快捷、準(zhǔn)確率高的特點(diǎn)。該篩選方法可與“濕法”實(shí)驗(yàn)結(jié)合，減少“濕法”實(shí)驗(yàn)次數(shù)，節(jié)省實(shí)驗(yàn)成本，提高篩選成功率。通過(guò)計(jì)算機(jī)輔助模擬分析得到適配過(guò)程中蛋白質(zhì)與核酸分子間化學(xué)反應(yīng)機(jī)理等信息，并將數(shù)據(jù)在終端進(jìn)行展示，并在揭示相應(yīng)生物材料與核酸分子間可能的相互作用機(jī)理方面提供數(shù)據(jù)支撐，因此具有重要的研究意義和使用價(jià)值。?? |
