基于深度學(xué)習(xí)的MHC-I表位親和力預(yù)測(cè)方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202010539194.8 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開（公告）號(hào) | CN112002374A | 公開（公告）日 | 2020-11-27 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN112002374A | 申請(qǐng)公布日 | 2020-11-27 |
| 分類號(hào) | G16B40/00(2019.01)I | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 任樹成;宋瑾;張恒輝;沈?qū)?/td> | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 北京臻知醫(yī)學(xué)科技有限責(zé)任公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京中珒知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（特殊普通合伙） | 代理人 | 北京臻知醫(yī)學(xué)科技有限責(zé)任公司 |
| 地址 | 102600北京市大興區(qū)中關(guān)村科技園區(qū)大興生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)基地寶參南街16號(hào)院2號(hào)樓2層201-2 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開一種基于深度學(xué)習(xí)的MHC?I表位親和力預(yù)測(cè)方法，其包括：通過公共數(shù)據(jù)庫(kù)獲取多數(shù)個(gè)多肽；根據(jù)MHC?I分子與肽的結(jié)合方式將所述多肽轉(zhuǎn)換為21mer肽；提取所述多肽的特征，所述特征包括：序列特征、親水性特征、極性特征和位置特征；分別對(duì)所述多肽的特征進(jìn)行特征編碼，得到4*21維的特征矩陣；將所述公共數(shù)據(jù)庫(kù)中的多肽數(shù)據(jù)作為訓(xùn)練集進(jìn)行模型訓(xùn)練，根據(jù)所述多肽的等位基因的分類，分別將所述多肽的特征矩陣輸入預(yù)先建立的CNN模型建立預(yù)測(cè)模型，建立的預(yù)測(cè)模型的數(shù)量與所述多肽的等位基因的分類數(shù)據(jù)相對(duì)應(yīng)；使用所述公共數(shù)據(jù)庫(kù)的多肽數(shù)據(jù)作為所述預(yù)測(cè)模型的驗(yàn)證集進(jìn)行結(jié)合親和力測(cè)試。通過本申請(qǐng)能夠有效預(yù)測(cè)MHC?I表位親和力，預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性較高且更穩(wěn)定。?? |
