一種用于宏基因組學(xué)病原體檢測參考閾值建立的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110895536.4 申請日 -
公開（公告）號 CN113571128A 公開（公告）日 2021-10-29
申請公布號 CN113571128A 申請公布日 2021-10-29
分類號 G16B20/00（2019.01）I;G16B25/20（2019.01）I;G16B30/10（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I;C12Q1/6869（2018.01）I;C12Q1/04（2006.01）I 分類 物理
發(fā)明人 申奧;吳紅龍 申請（專利權(quán)）人 華大生物科技（武漢）有限公司
代理機構(gòu) 北京紀(jì)凱知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 張立娜
地址 518052廣東省深圳市前海深港合作區(qū)南山街道臨海大道59號海運中心口岸樓0605A房
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種用于宏基因組學(xué)病原體檢測參考閾值建立的方法。該方法包括：確定臨床樣本類型；確定其組成成分及人源細(xì)胞含量分布范圍；設(shè)置梯度陰性對照；對陰性對照樣本按照待測臨床樣本即將進(jìn)行的宏基因組檢測流程進(jìn)行多批次重復(fù)測試；統(tǒng)計不同人源細(xì)胞濃度的陰性對照樣本中不同病原體的檢測序列數(shù)，得到對應(yīng)病原體在不同人源細(xì)胞濃度的陰性對照樣本的檢測序列數(shù)波動區(qū)間；以對應(yīng)病原體在陰性對照樣本中的檢測序列數(shù)波動區(qū)間上限的120％為閾值。本發(fā)明能實現(xiàn)樣本檢測結(jié)果分層判別，提高宏基因組學(xué)病原檢測結(jié)果準(zhǔn)確性；可提高報告解讀效率；可有效減少宏基因組檢測結(jié)果的假陽性；可實時評估檢測流程中的污染，指導(dǎo)實驗室流程改進(jìn)。