基于RNA靶向測序和機器學習的癌癥亞型分型方法及裝置

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910783893.4 申請日 -
公開（公告）號 CN110400601A 公開（公告）日 2019-11-01
申請公布號 CN110400601A 申請公布日 2019-11-01
分類號 G16B20/00（2019.01）I; C12Q1/6869（2018.01）I 分類 物理
發(fā)明人 楊家亮; 王博; 郎繼東; 梁樂彬; 張燕香; 孫雪; 王偉偉; 王興枝; 時淑舫; 田埂 申請（專利權(quán)）人 元碼基因科技（無錫）有限公司
代理機構(gòu) 北京北匯律師事務所 代理人 元碼基因科技（無錫）有限公司
地址 214000 江蘇省無錫市錫山區(qū)安鎮(zhèn)街道丹山路88號錫東創(chuàng)融大廈C座208
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開基于RNA靶向測序和機器學習的癌癥亞型分型方法及裝置。本發(fā)明通過RNA靶向測序技術(shù)，高效富集目標基因區(qū)域，經(jīng)過反轉(zhuǎn)錄、建庫、測序步驟，得到目標區(qū)域的二代測序數(shù)據(jù)，并利用隨機森林算法在TCGA數(shù)據(jù)集上訓練得到腫瘤分型預測模型，從而準確地進行癌癥多亞型分型。基于本發(fā)明的方法得到能夠高準確率對肺癌和腎細胞癌分型模型。本發(fā)明的方法能夠降低分型成本，而且分型速度、精度、分析結(jié)果的準確率上均超過傳統(tǒng)方法。