一種基于Primer3的bPrimer批量PCR引物設(shè)計方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201610089004.0 申請日 -
公開（公告）號 CN105718759B 公開（公告）日 2018-09-25
申請公布號 CN105718759B 申請公布日 2018-09-25
分類號 G06F19/20 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 戴立忠;彭厘旻;郭鑫武;陳明;王煜;羅喜鵬 申請（專利權(quán)）人 湖南圣維基因科技有限公司
代理機構(gòu) 北京弘權(quán)知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 逯長明;許偉群
地址 410600 湖南省長沙市岳麓區(qū)高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開發(fā)區(qū)麓松路680號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種基于Primer3的bPrimer批量PCR引物設(shè)計方法，所述方法包括：獲取目標(biāo)DNA序列的原始序列；提取DNA多態(tài)性數(shù)據(jù)中的高頻多態(tài)性位點；對所述高頻多態(tài)性位點進(jìn)行標(biāo)記；輸出標(biāo)記高頻多態(tài)性位點的注釋序列，所述注釋序列和所述原始序列的堿基長度相同；讀取所述注釋序列，并生成候選引物；篩選候選引物等。本發(fā)明提供的基于Primer3的bPrimer批量PCR引物設(shè)計方法能夠回避高頻多態(tài)性位點，減少因目標(biāo)人群遺傳多樣性而導(dǎo)致的擴增失??；能夠批量檢測引物的特異性，減少非特異擴增、引物二聚體等原因?qū)е碌臄U增失敗；能夠用于評估現(xiàn)有引物的特異性；能夠?qū)﹂L目標(biāo)片段進(jìn)行自動分割。