一種腫瘤突變肽MHC親和力預(yù)測方法及其應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201811448569.9 申請日 -
公開（公告）號(hào) CN109682978B 公開（公告）日 2020-07-03
申請公布號(hào) CN109682978B 申請公布日 2020-07-03
分類號(hào) C12Q1/6886 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 丁平 申請（專利權(quán)）人 四川康德賽醫(yī)療科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京中政聯(lián)科專利代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 四川康德賽醫(yī)療科技有限公司;丁平
地址 610093 四川省成都市高新區(qū)科園南路88號(hào)12棟201號(hào)
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提出了一種腫瘤突變肽MHC親和力的預(yù)測方法，包括如下步驟：(一)腫瘤特異性突變序列的獲??；(二)對(duì)突變肽MHC親和力預(yù)測，以所述突變序列翻譯成預(yù)定長度的氨基酸FASTA序列，獲得測試肽；對(duì)所述測試肽分別進(jìn)行與MHCI分子、MHCII分子的親和力評(píng)估，按照確定的等級(jí)標(biāo)準(zhǔn)篩選突變肽；(三)對(duì)步驟(二)中篩選出的具有高親和力所述突變肽，進(jìn)行蛋白酶體切割預(yù)測，篩選出能夠被蛋白酶體有效切割的所述突變肽；(四)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)合成步驟(三)驗(yàn)證突變肽與患者特有MHC的親和力。本發(fā)明還提出了一種基于腫瘤突變肽MHC親和力的預(yù)測方法在篩選腫瘤新生抗原及制備個(gè)性化腫瘤疫苗中的用途。