一種腫瘤通用疫苗的設(shè)計方法及其在胰腺癌的應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910015841.2 申請日 -
公開(公告)號 CN109584966A 公開(公告)日 2019-04-05
申請公布號 CN109584966A 申請公布日 2019-04-05
分類號 G16B40/00(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 莫凡; 周秀卿; 陳榮昌; 馬治明; 王慧敏; 韓寧; 陳樞青 申請(專利權(quán))人 杭州芯遞力生物科技有限公司
代理機構(gòu) 杭州裕陽聯(lián)合專利代理有限公司 代理人 杭州紐安津生物科技有限公司
地址 310000 浙江省杭州市濱江區(qū)西興街道江陵路88號5幢2樓A區(qū)-73
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種腫瘤通用疫苗的設(shè)計方法及其在胰腺癌的應(yīng)用,設(shè)計方法包括:尋找腫瘤的所有突變位點的數(shù)據(jù);對體細胞突變數(shù)據(jù)進行突變功能過濾,保留了外顯子區(qū)域和可變剪切類型的突變位點;分析每個突變位點在對應(yīng)癌癥人群中的突變頻率;利用數(shù)據(jù)計算每個基因在對應(yīng)癌癥中的表達量;判斷多肽與MHC的親和力情況,選取突變型多肽免疫原性強的位點;若存在n個突變的組合滿足其中n為滿足條件的最小值,則為最大覆蓋的最少突變組合;將突變組合輸入疫苗設(shè)計程序,設(shè)計多肽疫苗序列;通過這樣的設(shè)計方法得到的通用型多肽疫苗組合覆蓋患者的覆蓋率高,縮短患者等待治療的時間,提高免疫效果,降低腫瘤的耐藥發(fā)生概率。