適用于單細(xì)胞全基因組甲基化與轉(zhuǎn)錄組共測序的文庫建立方法及其應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201710867619.6 申請日 -
公開（公告）號 CN107557874A 公開（公告）日 2018-01-09
申請公布號 CN107557874A 申請公布日 2018-01-09
分類號 C40B50/06(2006.01)I;C12Q1/6869(2018.01)I 分類 組合技術(shù)〔8〕;
發(fā)明人 陳昌岳;王芳;李靜;張祥林;胡秋萍;段彪;張培培;董東;任一;鄭冠濤;路遠(yuǎn) 申請（專利權(quán)）人 上海美吉醫(yī)學(xué)檢驗有限公司
代理機(jī)構(gòu) 上海光華專利事務(wù)所（普通合伙） 代理人 上海美吉醫(yī)學(xué)檢驗有限公司
地址 200120 上海市浦東新區(qū)康新公路3399號3號樓5層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，具體公開了一種適用于單細(xì)胞的全基因組甲基化與轉(zhuǎn)錄組共測序的文庫建立方法，包括如下步驟：（1）細(xì)胞裂解；（2）對細(xì)胞裂解液進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄，使細(xì)胞裂解液中的RNA反轉(zhuǎn)錄成為cDNA；（3）步驟（2）處理后的基因組DNA和cDNA分離；（4）以分離后基因組DNA構(gòu)建甲基化文庫，cDNA構(gòu)建轉(zhuǎn)錄組文庫；其中，步驟（4）中所述基因組DNA甲基化文庫構(gòu)建包括以下步驟：（4?1）對所述基因組DNA進(jìn)行重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化；（4?2）對步驟（4?1）中轉(zhuǎn)化后的基因組DNA進(jìn)行線性擴(kuò)增；（4?3）對步驟（4?2）中線性擴(kuò)增的擴(kuò)增子進(jìn)行指數(shù)擴(kuò)增，所述指數(shù)擴(kuò)增的擴(kuò)增子用作文庫。